De huidige gemeente Houten bestond oorspronkelijk uit vijf gemeenten met vier schouten. In 1812 en 1813 spreekt men over maire. Houten viel toen onder het Franse Keizerrijk, departement Zuiderzee met hoofdstad Amsterdam.
Tussen 1818 en 1825 spreekt men over schout. De huidige gemeente Houten viel toen onder Verenigd Koninkrijk der Nederlanden, provincie Utrecht. Vanaf 23 juli 1825 is sprake van de functie burgemeester. Tot 1851 werd de burgemeester benoemd op voordracht van de ambachtsheer.
De gemeenten Houten, Schonauwen en Oud Wulven (1812 – 1962)
| Jaar | Houten | Oud Wulven | Schonauwen |
| 1812 | A. Lagerweij | A. Lagerweij | A. Lagerweij |
| 1818 | G.H. Stevens | G.H. Stevens | P. de Goey |
| 1818 | G.H. Stevens | G.H. Stevens | J.G. Buddingh |
| 1819 | A. Lagerweij | A. Lagerweij | J.G. Buddingh |
| 1822 | J.G. Buddingh | J.G. Buddingh | J.G. Buddingh |
| 1824 | H. van Hulsteijn | H. van Hulsteijn | J.G. Buddingh |
| 1840 | S. van Raven | S. van Raven | J.G. Buddingh |
| 1841 | S. van Raven | S. van Raven | W. J. de Voogt |
| 1850 | S. van Raven | S. van Raven | S. van Raven |
In 1858 gaan deze drie gemeenten verder onder de gemeente Houten.
| 1858 | S. van Raven |
| 1877 | J. Waller |
| 1925 | H.J.J. Scholtens |
| 1931 | V.R. Los |
| 1943 | A.W. Bosschaart |
| 1945 | V.R. Los |
| 1946 | A.B. Haefkens |
| 1959 | E.A.M.J. Weijer (waarnemend) |
Gemeente Tull en ’t Waal cs (1812 – 1962)
| 1812 | B.v.d. Pouw |
| 1818 | D. Rother |
| 1827 | W. Lagerweij |
| 1850 | A.J.E. Hooft van Huysduynen |
| 1852 | S. van Raven |
| 1855 | J.J. Groeneveldt |
| 1860 | J.W. van den Boogaard |
| 1885 | J.P. Kleinschmit |
| 1923 | L.P.J. ten Holder |
| 1943 | A.W. Bosschaart |
| 1945 | K.M. Vink (waarnemend) |
| 1946 | A.B. Haefkens |
| 1959 | E.A.M.J. v.d. Weijer (waarnemend) |
Sinds 1850 hebben de gemeenten Tull en ’t Waal en Schalkwijk dezelfde persoon als burgemeester. Vanaf 1935 neemt de onvrede in Tull en ’t Waal toe en voelt de bevolking zich ondergesneeuwd door Schalkwijk. Een deel van de bevolking wil bij Houten horen.
Gemeente Schalkwijk (1812 – 1962)
| 1812 | B.v.d. Pouw |
| 1838 | A.J.E. Hooft van Huysduynen |
| 1852 | S. van Raven |
| 1855 | J.J. Groeneveldt |
| 1860 | J.W. van den Boogaard |
| 1885 | J.P. Kleinschmit |
| 1923 | L.P.J. ten Holder |
| 1943 | A.W. Bosschaart |
| 1945 | K.M. Vink (waarnemend) |
| 1946 | A.B. Haefkens |
| 1959 | E.A.M.J. v.d. Weijer (waarnemend) |
Huidige gemeente Houten (1962 – heden)
Vanaf 1946 is er sprake van één burgemeester voor drie gemeenten. In de periode 1852-1856 en 1943-1945 was dat ook al zo. In de periode 1959-1962 heeft de burgemeester van Bunnik, Werkhoven en Odijk ook de gemeenten Houten, Schalkwijk en Tull en ’t Waal erbij. Sinds 1962 is er één nieuwe gemeente Houten met één burgemeester.
| 1962 | F.J.W.A. Albers Pistorius In 1969 tijdelijk waarnemend burgemeester L. Schuman |
| 1972 | Wethouder J.W. Vulto (waarnemend) |
| 1972 | W.H.Bijleveld |
| 1983 | Wethouder G.A. Jonkers (waarnemend) |
| 1983 | A.J. Bransen |
| 1992 | A.B.L. de Jonge |
| 2000 | J.J.F.M. Westra (waarnemend) |
| 2001 | C.H.J. Lamers |
| 2012 | R.G. Boekhoven (waarnemend) |
| 2013 | W.M. de Jong |
| 2019 | G. Isabella |