De huidige gemeente Houten bestond oorspronkelijk uit vijf gemeenten met vier schouten. In 1812 en 1813 spreekt men over maire. Houten viel toen onder het Franse Keizerrijk, departement Zuiderzee met hoofdstad Amsterdam.
Tussen 1818 en 1825 spreekt men over schout. De huidige gemeente Houten viel toen onder Verenigd Koninkrijk der Nederlanden, provincie Utrecht. Vanaf 23 juli 1825 is sprake van de functie burgemeester.
De gemeenten Houten, Schonauwen en Oud Wulven
Tot 1851 werd de burgemeester benoemd op voordracht van de ambachtsheer. De drie gemeenten Houten, Schonauwen en Oud Wulven hadden toen al dezelfde burgemeester.
Gemeente Houten
| 1858 | S. van Raven |
| 1877 | J. Waller |
| 1925 | H.J.J. Scholtens |
| 1931 | V.R. Los |
| 1943 | A.W. Bosschaart |
| 1945 | V.R. Los |
| 1946 | A.B. Haefkens |
| 1959 | E.A.M.J. Weijer (waarnemend) |
Gemeente Tull en ’t Waal cs
| 1812 | B.v.d. Pouw |
| 1818 | D. Rother |
| 1827 | W. Lagerweij |
Gemeente Schalkwijk
| 1812 | B.v.d. Pouw |
| 1838 | A.J.E. Hooft van Huysduynen |
Schalkwijk en Tull en ’t Waal cs
Sinds 1850 hebben de gemeenten Tull en ’t Waal en Schalkwijk dezelfde persoon als burgemeester. Daarmee is de situatie van voor 1818 hersteld.
| 1850 | A.J.E. Hooft van Huysduynen |
| 1852 | S. van Raven |
| 1855 | J.J. Groeneveldt |
| 1860 | J.W. van den Boogaard |
| 1885 | J.P. Kleinschmit |
| 1923 | L.P.J. ten Holder |
| 1943 | A.W. Bosschaart |
| 1945 | K.M. Vink (waarnemend) |
| 1946 | A.B. Haefkens |
| 1959 | E.A.M.J. v.d. Weijer (waarnemend) |
Huidige gemeente Houten
Vanaf 1946 is er sprake van één burgemeester voor drie gemeenten. In de periode 1852-1856 en 1943-1945 was dat ook al zo. In de periode 1959-1962 heeft de burgemeester van Bunnik ook de gemeenten Houten, Schalkwijk en Tull en ’t Waal erbij. Sinds 1962 is er één nieuwe gemeente Houten met één burgemeester.
| 1962 | F.J.W.A. Albers Pistorius In 1969 tijdelijk waarnemend burgemeester L. Schuman |
| 1972 | Wethouder J.W. Vulto (waarnemend) |
| 1972 | W.H.Bijleveld |
| 1983 | Wethouder G.A. Jonkers (waarnemend) |
| 1983 | A.J. Bransen |
| 1992 | A.B.L. de Jonge |
| 2000 | J.J.F.M. Westra (waarnemend) |
| 2001 | C.H.J. Lamers |
| 2012 | R.G. Boekhoven (waarnemend) |
| 2013 | W.M. de Jong |